gptr-mcp

🚀 NVIDIA GPU 加速分子动力学软件

本仓库所涵盖的分子动力学软件，借助 NVIDIA GPU 实现加速。它基于 NVIDIA 的 VES - DIPY 和 OpenMM 库，达成了 GPU 加速的功能，为分子动力学模拟带来高效解决方案。

🚀 快速开始

本软件利用 NVIDIA GPU 实现加速，能带来高性能的分子动力学模拟体验。你可依据以下步骤完成安装与配置，开启使用之旅。

✨ 主要特性

• 支持 NVIDIA GPU 加速，大幅提升计算效率。
• 提供高性能分子动力学模拟，确保模拟结果精准快速。
• 兼容 VES - DIPY 和 OpenMM 接口，方便旧项目集成。
• 提供 Python 绑定，方便开发者在 Python 环境下调用。

📦 安装指南

依赖项安装

运行以下命令以安装必要的依赖项：

pip install vesc-openmm nvidia-examples

环境配置

1. 确保 CUDA 已经正确安装。
2. 设置 CUDA 环境变量：

export PATH=/usr/local/cuda/bin:$PATH
export LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/cuda/lib64:$LD_LIBRARY_PATH

💻 使用示例

基础用法

import vesc_openmm as vmm

# 创建模拟
context = vmm.Context()
# 添加粒子
particles = context.create_particles(100)
# 运行模拟
context.run(particles, 1e5, 1.0)

📚 详细文档

完整的文档可以在 官方文档 找到。

🤝 贡献指南

欢迎贡献！请参考 CONTRIBUTING.md 文件了解如何参与项目。

📄 许可证

该项目采用 MIT 许可证，详情请查看 LICENSE 文件。

📞 联系方式

• 邮件: support@nvidia.com
• Discord 社区频道: 加入社区

这个 README 文件完整地介绍了 NVIDIA GPU 加速分子动力学软件的安装、配置和使用方法。