biomcp

🚀 生物医学上下文模型协议（BioMCP）

BioMCP 是一个遵循 MIT 许可证的开源工具包，致力于为 AI 助手和代理赋予专业的生物医学知识。它基于 Model Context Protocol (MCP) 构建，能让 AI 系统连接权威生物医学数据源，精准且深入地回答临床试验、科学文献和基因组变异等方面的问题。

🚀 快速开始

对于 Claude Desktop 用户

1. 安装并配置 BioMCP 插件。
2. 使用示例命令直接运行：

   biomcp --example prompt
   

3. 查看详细输出和结果分析。

通用安装步骤

1. 下载 BioMCP 软件包：

   pip install biomcp
   

2. 按照文档中的分步指南进行设置。
3. 运行示例代码以熟悉工具的基本用法。

✨ 主要特性

尽管大型语言模型拥有广泛的知识库，但它们通常缺乏专业领域的特定信息或无法访问最新的资源。BioMCP 的优势在于弥补了这一不足：

• 结构化访问：连接到权威的生物医学数据源，确保获取准确且最新的信息。
• 自然语言查询：支持通过自然语言提问的方式，方便用户进行信息检索。
• 跨平台兼容性：与多种 AI 系统和工具兼容，提升集成性和扩展性。

📦 安装指南

对于 Claude Desktop 用户

1. 安装并配置 BioMCP 插件。
2. 使用示例命令直接运行：

   biomcp --example prompt
   

通用安装步骤

1. 下载 BioMCP 软件包：

   pip install biomcp
   

2. 按照文档中的分步指南进行设置。

💻 使用示例

基础用法

# 对于 Claude Desktop 用户运行示例命令
biomcp --example prompt

# 通用安装后运行示例代码
# 这里假设示例代码在安装后可直接运行，具体代码根据实际情况
# 例如可能有一些简单的查询代码

📚 详细文档

测试与验证

使用 MCP Inspector 工具对 BioMCP 设置进行全面测试，确保系统正常运行。通过以下步骤：

1. 下载并安装 MCP Inspector。
2. 配置 Inspector 以连接到您的 BioMCP 实例。
3. 运行全面的检查和报告生成。

企业版：OncoMCP

OncoMCP 是 BioMCP 的扩展版本，专为医疗健康领域设计：

• HIPAA 合规部署：确保数据传输和存储符合严格的隐私法规。
• 实时试验匹配：快速定位适合患者参与的临床试验。
• 高级规则处理：支持复杂的医学逻辑判断和决策辅助。

如需了解更多信息，请访问 GenomOncology 网站。

MCP 注册表

文档访问

如需详细了解 BioMCP，请访问 https://biomcp.org。

BioMCP 示例仓库

想要直观了解 BioMCP 的应用？

查看 companion 代码库： 👉 biomcp-examples

其中包含真实的提示、AI 自动生成的研究简报以及不同模型的评估运行。欢迎贡献您的示例，通过 fork 仓库并提交 PR 加入我们。

📄 许可证

此项目遵循 MIT 许可证。