JinDaGe - MedixHub MCP Details

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README

🚀 MedixHub模型上下文协议（MCP）服务器

MedixHub模型上下文协议（MCP）服务器集成了医疗和医疗保健API访问功能。它基于Model Context Protocol (MCP)，能为用户提供便捷、高效且安全的医疗数据交互服务。

✨ 主要特性

纯JavaScript实现：采用纯JavaScript开发，确保代码的简洁性和兼容性。
暴露具有标准化MCP元数据的功能：将功能以标准化的MCP元数据形式呈现，方便集成与使用。
执行带参数验证的功能：在执行功能时对参数进行验证，保证操作的准确性和安全性。
与Ollama等大型语言模型无缝集成：可与Ollama等大型语言模型轻松对接，拓展应用场景。
带有安全API端点的身份验证：提供安全的API端点，并支持身份验证，保障数据安全。
支持流式响应：支持流式响应，提升数据传输效率。

📦 安装指南

先决条件

Node.js 14或更高版本
npm或yarn

安装步骤

克隆仓库

git clone https://github.com/yourusername/medixhub-mcp-server.git
cd medixhub-mcp-server

安装依赖项

npm install

配置环境变量

cp .env.example .env
# 编辑.env文件以设置您的配置

启动服务器

npm start

若用于开发，可使用自动重载功能：

npm run dev

💻 使用示例

基础用法

使用/execute端点运行任何已注册的MedixHub功能：

POST /execute
Content-Type: application/json

{
  "name": "queryFDADrugLabel",
  "parameters": {
    "searchFields": {
      "drug_name": ["openfda.brand_name", "openfda.generic_name"]
    },
    "返回值": [
      "generic_name",
      "brand_name"
    ]
  }
}

功能说明

executeOpenTargetQuery：对OpenTarget API执行GraphQL查询以获取药物信息。
FDADrugLabelSearch：搜索FDA数据库中的药物标签信息。
get_drug_generic_name：根据品牌名称查找通用药物名称。
MonarchSearch：在Monarch知识库中搜索基因、疾病或表型。
MonarchDiseasesForMultiplePhenotypes：找到与多个表型相关的疾病。

📚 详细文档

实现的功能

该服务器包含JavaScript实现的以下功能：

executeOpenTargetQuery - 对OpenTarget API执行GraphQL查询
FDADrugLabelSearch - 从FDA数据库检索药物信息
get_drug_generic_name - 在通用名和品牌名之间映射药物名称
MonarchSearch - 搜索Monarch数据库中的基因、疾病或表型
MonarchDiseasesForMultiplePhenotypes - 找到与多个表型匹配的疾病

OpenTarget功能

疾病信息查询
药物细节和关联
目标（基因/蛋白质）信息
疾病 - 目标关联
药物 - 疾病关系

FDA药物标签功能

药物信息搜索
通用名和品牌名映射
不良反应查询
药物相互作用搜索

Monarch数据库功能

生物医学实体搜索
疾病 - 表型关联
基因 - 表型关系
多表型疾病查找

项目结构

medixhub-mcp-server/
├── server.js          # 主服务器文件
├── routes/           # API路由定义
│   ├── openTargetRoutes.js       # OpenTarget相关路由
│   └── monarchRoutes.js         # Monarch相关路由
├── controllers/      # 控制器逻辑
│   ├── openTargetController.js  # OpenTarget控制器
│   └── monarchController.js     # Monarch控制器
└── .env.example       # 环境变量示例文件

性能考虑

所有API调用都使用异步处理
启用了速率限制以防止滥用
超时处理可防止请求挂起
内存使用经过优化，以高效处理流

📄 许可证

该项目根据MIT许可证发布 - 有关详细信息，请参阅LICENSE文件。

MedixHub