Back to skills
extension
Category: Data & AnalyticsNo API key required

matchms

面向代谢组学的谱图相似度计算与化合物鉴定。用于比较质谱、计算相似度得分(cosine、modified cosine),并从谱图库中鉴定未知化合物。最适合代谢物

personAuthor: u_d4b8e350hubenterprise

Matchms 质谱相似性分析

  • 唯一标识:hub-matchms
  • 显示名称:Matchms 质谱相似性分析
  • 能力摘要:使用 Matchms 导入、规范化、过滤和比较质谱数据,计算谱图相似度并构建可复现的代谢组或化学分析工作流。

案例素材

  1. 代谢组团队收到来自两台仪器的谱图。该 skill 会统一元数据、离子模式和峰过滤规则,保留原始文件与处理参数,避免将不同采集条件直接混合比较。
  2. 研究者要查找重复化合物。该 skill 会以设定的 m/z 与强度阈值计算谱图相似度,输出候选匹配和分数,并要求结合标准品或注释证据确认身份。
  3. 管道升级后结果发生变化。该 skill 会固定测试谱集、比较预处理和相似度输出,记录库版本与阈值,分辨算法变化和数据质量变化。