药物靶点筛选
概述
本 skill 对应:药企 / 药物研发辅助 / 药物靶点筛选。
要求:药企研发场景。
来源核验
- 匹配来源:Open Targets Database
- 来源类型:公开 Agent Skill
- 来源链接:https://agent-skills.md/skills/x-cmd/skill/opentargets-database
- 匹配结论:匹配。该 skill 明确覆盖 target-disease association、known drugs、druggability、safety 与 target prioritization。
参考部分
只参考 Open Targets Database skill 的 target-disease association 与 target prioritization 部分:
- 疾病/适应症与候选靶点关联
- 证据强度整理
- 可成药性整理
- 安全风险整理
- 候选靶点优先级排序
不参考部分
- 不参考外部数据库实时查询
- 不参考分子生成、化合物设计或合成路线
- 不参考临床试验设计
- 不扩展到医学事务资料生成
构建方式
OpenClaw 中应构建为一个独立的筛选型 skill:
- 输入疾病/适应症和候选靶点列表
- 按证据强度、可成药性、安全风险生成靶点优先级
- 输出候选靶点筛选 JSON
建议输入字段
disease:疾病或适应症targets:候选靶点列表target:靶点名称或基因符号mechanism:作用机制evidence:证据描述或证据强度druggability:可成药性safety_risk:安全风险references:来源引用
建议输出字段
skill:药物靶点筛选diseaseranked_targetsscreening_basis
医疗边界
本 skill 只做药物研发候选靶点筛选整理,不构成临床诊断、治疗建议或药品有效性结论。
快速开始
从本 skill 目录执行:
python3 scripts/run.py --input input.json --output output.json --appkey YOUR_KEY
最小输入示例
{
"disease": "非小细胞肺癌",
"targets": [
{
"target": "EGFR",
"mechanism": "抑制肿瘤驱动信号",
"evidence": "high",
"druggability": "high",
"safety_risk": "medium",
"references": ["example-ref"]
}
]
}
输出约定
输出 UTF-8 JSON,采用统一格式:
{
"skill": "技能名称",
"status": "ok",
"data": { /* 结构化数据 */ },
"text": "API 生成的 Markdown/自然语言内容,OpenClaw 直接渲染给用户"
}
data:本地预处理得到的结构化数据text:内部医疗大模型生成的自然语言解读/分析/提醒,Markdown 格式
支持的输入格式
除 JSON 外,还支持以下格式(通过 --input-type 自动检测或手动指定):
| 格式 | 说明 | |------|------| | JSON | 默认,直接读取结构化输入 | | CSV / XLSX / XLS | 表格数据,按列头自动映射字段 | | TXT / MD | key:value 文本格式(支持中文/英文字段名) | | PDF / DOC / DOCX | 文档,提取文本后解析 | | PNG / JPG 等图片 | OCR 提取文本后解析 |
统一入口附加参数
--input-type auto|pdf|doc|docx|xls|xlsx|csv|txt|json:输入类型;默认auto。--sheet STRING:读取 Excel 时指定 sheet(可选)。--encoding STRING:txt/csv编码(默认:utf-8)。--save-prepared:保存预处理后的 JSON,便于调试。--appkey STRING:必填。内部医疗大模型鉴权 key,由用户在 OpenClaw 中调用时提供。本 skill 强制通过 API 进行靶点筛选排序,无本地透传模式。
依赖
运行环境
- Python 3.7+
Python 第三方包(可选,按输入格式需要)
| 包名 | 用途 | 必要条件 |
|------|------|---------|
| openpyxl | 读取 .xlsx 文件 | 输入为 xlsx 时必须 |
| pypdf | 提取 PDF 文本 | 输入为 pdf 时必须 |
外部工具(可选,按输入格式需要)
| 工具 | 用途 | 必要条件 |
|------|------|---------|
| LibreOffice (soffice) | 转换 .doc / .xls | 输入为 doc/xls 时必须 |
| pdftotext(poppler-utils) | 提取 PDF 文本 | 输入为 pdf 且未安装 pypdf 时 |
| tesseract(含 chi_sim+eng) | 图片 OCR | 输入为图片时必须 |
仅使用 JSON 输入时,无需安装任何第三方包或外部工具。
模型配置
本 skill 执行时通过内部医疗大模型进行推理:
- endpoint:
https://maas-api.hivoice.cn/v1/chat/completions - model:
u1-insuremed - 协议:OpenAI Chat Completions(兼容标准 /v1/chat/completions)
- 鉴权:通过
--appkey参数传入 Bearer token,由用户在 OpenClaw 中调用时提供
本 skill 强制走 API 推理,无本地透传模式。
强制通过
--appkey调用内部医疗大模型进行推理,无本地兜底模式。
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