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🚀 PubMed 分析 MCP 服务器

这是一个专业的PubMed医学文献分析MCP服务器，能助力科研人员快速洞察医学研究动态。本项目由苦逼医学生开发，目前功能仍在完善中，欢迎各位提出建议和改进！

🚀 快速开始

安装依赖

# 安装依赖
pip install -r requirements.txt  
# 或使用uv
uv pip install -r requirements.txt

配置 mcp.json

因为习惯用uv虚拟环境，所以这里直接使用python的路径运行python文件。

// Add the following configuration in mcp.json (for Windows)
"PubMed": {
        "command": "cmd",
        "args": [
          "/c",
          "path/to/python.exe",
          "path/to/server.py"
        ]
    }
// For example, my mcp.json file looks like this
{
    "mcpServers": {
      "fetch":{
        "command": "cmd",
        "args": [
          "/c",
          "uvx",
          "mcp-server-fetch"
        ]
      },
      "PubMed": {
        "command": "cmd",
        "args": [
          "/c",
          "path/to/python.exe",
          "path/to/server.py"
        ]
      }
    }
  }

LLM 提示 (Agent 模式)

/your_mcp_name (note: it is PubMed here) Help me analyze the research hotspots on prostate cancer immunotherapy in the past three months. Set top_n to 50 and max_results to 5000. My email adress is ...  
/your_mcp_name（注：比如我的mcp.json里面是PubMed）帮我分析一下近三个月前列腺癌免疫治疗的研究热点。top_n设置为50，max_results设置为5000。我的电子邮件地址是...

✨ 主要特性

• 文献检索：支持PubMed高级检索语法，可设置日期范围和结果数量。
• 热点分析：统计关键词频率，识别热门研究方向，汇总相关文献。
• 趋势追踪：追踪关键词随时间的频率变化，揭示研究趋势演变。
• 发文统计：提供灵活的时间周期设置，分析文献数量变化。
• 全面报告：一键生成包含热点、趋势和统计的分析报告。

📦 MCP工具

1. search_pubmed

搜索PubMed并保存结果。 主要参数：

• email：您的电子邮件（必填）
• advanced_search：PubMed搜索查询（必填，与高级检索语法相同）
• max_results：最大结果数（默认：1000）

2. list_result_files

列出可用的结果文件。

3. analyze_research_hotspots

分析研究热点。 主要参数：

• filename：结果文件名（必填）
• top_n：分析的关键词数量（默认：20）

4. analyze_research_trends

分析研究趋势。

5. analyze_publication_count

分析发文数量。

6. generate_comprehensive_analysis

生成全面分析报告。

⚠️ 注意事项

⚠️ 重要提示

项目仍在开发中，功能可能尚未完善，请谨慎使用。