微信扫一扫把 Skill 的源码、资源快照、README、包体和安装信号放进一个可搜索、可筛选的公开目录。
通过FGP守护进程实现快速的OpenAI API操作（GPT、DALL-E、Whisper、嵌入）。当用户需要聊天补全、图像生成、音频转写、文本到语音或嵌入时使用。触发关键词包括“openai chat”、“generate image”、“transcribe audio”、“GPT completion”、“DALL-E”、“whisper transcribe”、“openai embed”…
Google Model Armor：过滤用户生成的内容以确保安全。
使用RDKit和Open Babel读取、写入和转换分子文件格式（SMILES、SDF、MOL2、PDB）。处理结构解析、规范化以及包括清理、标准化和互变异构体规范化的完整标准化流程。在加载化学库、转换格式或为分析准备分子时使用。
使用deepTools、Gviz和ChIPseeker可视化ChIP-seq数据。创建热图、轮廓图和基因组浏览器轨迹。可视化峰值周围、TSS或自定义区域的信号。在可视化ChIP-seq信号和峰值时使用。
选择并应用对色盲友好的调色板用于科学图表，使用viridis、RColorBrewer和自定义颜色方案。在为图表选择色盲友好型调色板时使用。
构建时间尺度的系统发育树，并使用TreeTime和BEAST2推断爆发分析中的进化动态。估算分化时间、分子钟速率和祖先状态。在确定爆发起源时间、估计传播率或构建时间校准的树时使用。
无监督聚类和细胞类型鉴定，适用于流式/质谱细胞术。涵盖FlowSOM、Phenograph和CATALYST工作流程。在没有预定义门的情况下，用于发现高维细胞术数据中的细胞群体。
使用Cas-OFFinder和CFD评分算法预测CRISPR脱靶位点。识别全基因组范围内的潜在非预期切割位点，并评估导向RNA的特异性。在评估导向RNA特异性或选择具有最小脱靶风险的导向RNA时使用。
索引YouTube频道的视频和字幕以进行语义搜索。当用户说“索引YouTube”、“添加YouTube频道”、“更新视频索引”或“索引字幕”时使用。可以与solograph MCP（如果可用）一起使用，或者通过yt-dlp独立使用。
Google模型护甲：通过模型护甲模板净化模型响应。
使用RDKit通过指纹的Tanimoto系数执行分子相似性搜索。使用ECFP或MACCS键找到结构相似的化合物，并使用Butina聚类方法按结构相似性对分子进行聚类。在查找查询化合物的类似物或对化学库进行聚类时使用。
使用PAML和IQ-TREE边际似然方法在系统发育节点上重建祖先序列。推断古代蛋白质序列并通过序列历史追踪进化轨迹。在推断用于蛋白质复活的祖先状态或追踪进化历史时使用。
使用pyGenomeTracks、Gviz和IGV创建基因组浏览器风格的可视化，显示多个数据轨道（覆盖度、峰值、基因）。当需要在特定基因座上以多条对齐轨道的形式可视化基因组数据时，请使用此方法。
使用TransPhylo和疫情重建算法推断病原体传播网络，并识别可能的传播对。从基因组和流行病学数据中估计谁感染了谁。在调查疫情传播链或识别超级传播者时使用。
使用pySCENIC从单细胞RNA-seq数据中推断基因调控网络并识别转录因子调节子。通过GRNBoost2发现共表达模块，通过顺式调控基序富集进行修剪，并使用AUCell为每个细胞的调节子活性打分。当识别转录因子调节子、在单个细胞中评分TF活性或寻找细胞身份的主要调节因子时使用。
创建和读取bigWig浏览器轨迹以可视化连续的基因组数据。使用UCSC工具和pyBigWig将bedGraph转换为bigWig，提取信号值，并生成覆盖轨迹。在为基因组浏览器准备覆盖轨迹或在特定区域提取信号时使用。
分析文章结构，确定需要视觉辅助的位置，使用Type × Style二维方法生成插图。当用户要求“为文章配图”、“添加图片”、“为文章生成图片”时使用。
使用RDKit计算分子描述符和指纹。计算Morgan指纹（ECFP）、MACCS键、Lipinski属性、QED类药性、TPSA以及3D构象描述符。在为机器学习特征化分子或根据类药性标准过滤时使用。
使用RDKit的SMARTS模式搜索分子库以匹配子结构。通过药效团特征、官能团或带有原子映射的骨架匹配来筛选化合物。当寻找包含特定化学基团的化合物或按结构特征筛选库时使用。
使用Circos和pyCircos创建环形基因组图。显示多轨道数据，包括染色体图、基因、变异、拷贝数变异（CNVs）以及交互弧线。在创建环形基因组图时使用。
使用UpSetR或upsetplot创建UpSet图，以替代维恩图来可视化集合交集。当比较超过3个集合的重叠基因集、峰值集或样本组时使用。
使用Nextclade和pangolin分配病原体谱系并追踪变种，以进行病毒监测。监控变种的流行率并识别新出现的关注变种。在对病毒序列进行分类、追踪谱系动态或监测关注变种时使用。
使用Bakta对细菌和古菌基因组进行综合的结构和功能注释，或使用Prokka进行轻量级注释。生成与NCBI兼容的位点标签的GFF3、GenBank和FASTA输出文件。在注释新组装的原核生物基因组或准备向NCBI提交的注释时使用。
使用matplotlib、cooltools和HiCExplorer可视化Hi-C接触矩阵、TADs、环以及基因组特征。创建三角图、虚拟4C和多轨道图。在可视化接触矩阵或基因组特征时使用。