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seuratmap2ref
使用Seurat的参考映射工作流程将单细胞数据集映射到高质量的参考图谱。执行标签转移、UMAP投影，并与参考注释进行整合，而不修改查询表达数据。能够从像Azimuth PBMC这样的策划图谱或自定义组织特异性参考中进行迁移学习。
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Skill 资源库
AI Skill 资源库
把 Skill 的源码、资源快照、README、包体和安装信号放进一个可搜索、可筛选的公开目录。
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sfh-viz
为分形号角设计生成丰富的可视化效果。在渲染3D几何图形、创建声学图、模拟动画、构建仪表板或生成出版质量的图表时使用。作为所有SFH-OS代理的中心可视化枢纽。
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sfh-sim
对号角几何形状运行声学模拟，使用BEM分析。在评估号角性能、分析阻抗曲线、计算极性图或评分几何变化时使用。返回声学指标和可视化数据。
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sharp
高性能Node.js图片处理库。使用libvips最快速地调整JPEG、PNG、WebP、AVIF和TIFF图片大小。
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shodh-cloudflare
持久内存系统，用于在Cloudflare的边缘网络上运行的AI代理。使用此技能可以在对话中记住上下文、回忆相关信息并构建长期知识。当您需要存储决策、学习内容、错误或应持续到当前会话之外的上下文时，请激活此功能。
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signal-generator-agent
最终交易信号生成器。将来自所有分析源（战情室、手动分析、深度推理、CEO分析、新闻）的输出整合为具有适当归属的统一TradingSignal数据库条目。
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simulator-effect
意涵胜过模拟 —— 想象力创造（威尔·赖特）
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single-cell-multi-omics-integration
OmicVerse教程的快速参考表，涵盖了MOFA、GLUE配对、SIMBA集成、TOSICA转移和StaVIA制图。
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seuratsubclustering
对特定的细胞子集（例如，单个集群、细胞类型或自定义子集）进行细粒度的重新聚类。与仅在单个集群内寻找子集群的`Seurat::FindSubCluster`不同，此过程对由元数据过滤器或细胞条形码列表定义的任何细胞子集执行完整的聚类工作流程（PCA、UMAP、FindNeighbors、FindClusters）。
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sfh-gen
使用空间填充曲线和曼德勃罗扩展生成分形号角几何体。在设计号角拓扑、创建几何变体或探索用于声学优化的分形方法时使用。生成STL网格和分形分析数据。
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shape-memory
通过形状锚点而非线性日志实现AI原生会话连续性。在开始会话时使用以从前一状态进行定位，或在结束时固化状态以便未来实例使用。
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shatter-protocol
人类自主验证协议 - 通过定期的断电测试和多维度的能力评估，验证人类操作员保持与AI系统的功能独立性。
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shodh-memory
持久内存系统，用于AI代理。使用此技能可以在对话中记住上下文、回忆相关信息并构建长期知识。当您需要存储决策、学习内容、错误或应持续到当前会话之外的上下文时，请激活此功能。
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signal-factory-core
由AI驱动的信号工厂核心，用于处理可观测性信号并维护知识图谱。使用场景：(1) 开发信号引擎（新鲜度、漂移、合约、数据质量、数量、异常）；(2) 配置信号路由器以进行标准化和路由；(3) 为资产和血统设计Neptune图模式；(4) 实现DynamoDB状态管理以处理事件。触发条件：“创建信号引擎”、“配置信号路由器”、“设计图模式”、“实现信号处理”。
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single-cell-annotation-skills-with-omicverse
指导Claude通过SCSA、MetaTiME、CellVote、CellMatch、GPTAnno和加权KNN转移工作流来注释单细胞模态。
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single-cell-cellphonedb-communication-mapping
在已注释的单细胞数据上运行omicverse的CellPhoneDB v5封装，以推断配体-受体网络并生成类似CellChat风格的可视化。
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seuratclusterstats
为Seurat对象生成全面的集群统计数据和可视化，包括降维图、基因表达可视化、集群质量指标和clustree图。此过程对于探索和验证聚类结果至关重要。
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seuratclusteringofallcells
在细胞类型选择之前对所有细胞（包括T细胞、B细胞和非T/B细胞）进行粗略聚类。此过程识别出广泛的细胞群体，以便通过`TOrBCellSelection`进行后续的T/B细胞选择。与作用于已选择的T/B细胞上的`SeuratClustering`不同，该方法提供对异质性细胞群体的初始聚类。
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ralph-worker-techartist
技术美术工作循环 - 执行由协调员分配的视觉资产任务
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sheaf-laplacian-coordination
通过图拉普拉斯算子进行分布式剪切神经网络协调
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shownotes-generator
从长篇文章、论文、文字记录、视频或音频内容生成全面的“节目笔记”摘要。当用户请求节目笔记、剧集摘要、带有收获的内容摘要，或者提到mdynotes.com格式时使用。创建包含元数据、钩子、收获、引用和参考资料的结构化摘要。
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similarity-matcher
调查区域周边相似遗址的匹配及比较分析
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single-cell-preprocessing-with-omicverse
浏览omicverse的单细胞预处理教程，对PBMC3k数据进行质量控制、计数标准化、检测高变基因，并在CPU、CPU-GPU混合或GPU堆栈上运行PCA/嵌入流程。
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single-cell-clustering-and-batch-correction-with-omicverse
指导Claude完成omicverse的单细胞聚类工作流程，涵盖预处理、质量控制、多方法聚类、主题建模、cNMF以及批次间整合，如t_cluster.ipynb和t_single_batch.ipynb中所展示的。
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