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bio-virtual-screening
使用AutoDock Vina 1.2进行基于结构的虚拟筛选以实现分子对接。准备受体PDBQT文件，生成配体构象，定义结合位点框，并根据预测的结合亲和力对化合物进行排序。当针对蛋白质结构筛选化学库以寻找潜在结合物时使用。
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Skill 资源库
AI Skill 资源库
把 Skill 的源码、资源快照、README、包体和安装信号放进一个可搜索、可筛选的公开目录。
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bio-genome-annotation-eukaryotic-gene-prediction
使用BRAKER3结合RNA-seq和蛋白质证据，或使用GALBA仅基于蛋白质证据来预测真核生物基因组中的蛋白质编码基因。运行带有训练参数的Augustus以获得准确的基因模型。在注释新组装的真核生物基因组或改进现有的基因预测时使用。
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bio-single-cell-markers-annotation
使用Seurat（R）和Scanpy（Python）在单细胞RNA测序中寻找标记基因并注释细胞类型。用于集群之间的差异表达分析、识别特定于集群的标记、评分基因集以及分配细胞类型标签。当寻找标记基因和注释集群时使用。
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bio-workflows-biomarker-pipeline
从表达数据到验证生物标志物面板的端到端生物标志物发现工作流程。涵盖使用Boruta/LASSO进行特征选择、使用嵌套CV训练分类器以及SHAP解释。在从组学数据构建和验证诊断或预后生物标志物签名时使用。
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fetch-page
获取并总结一个网页
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sirv-api
Sirv REST API集成用于图像和文件管理。当与Sirv CDN工作时使用，包括上传/下载文件到Sirv、管理图像元数据、搜索文件、创建360度旋转视图、转换视频或执行任何Sirv API操作。涵盖身份验证、文件操作、元数据、搜索查询、异步任务以及账户管理。
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p-image
通过inference.sh CLI使用Pruna P-Image模型生成图像。模型包括：P-Image、P-Image-LoRA、P-Image-Edit、P-Image-Edit-LoRA。功能包括：文本转图像、图像编辑、LoRA风格、多图像合成、快速推理。Pruna在不损失质量的情况下优化了模型的速度。触发词：pruna, p-image, pruna image, fast image g…
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computer-vision-warehouse
当用户想要在仓库中应用计算机视觉，检测缺陷、跟踪包裹、计数库存或自动化视觉检查时。或者当用户提到“计算机视觉”、“图像识别”、“物体检测”、“条形码读取”、“包裹跟踪”、“质量检查”、“YOLO”、“RCNN”、“图像分类”或“基于视觉的仓库自动化”时。对于一般的机器学习，请参阅ml-supply-chain。
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bio-epitranscriptomics-m6anet-analysis
使用m6Anet从Oxford Nanopore直接RNA测序中检测m6A修饰。在不使用免疫沉淀的情况下分析长读长RNA数据中的表观转录组修饰时使用。
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bio-machine-learning-biomarker-discovery
使用Boruta全相关选择、mRMR最小冗余和LASSO正则化为生物标志物发现选择信息性特征。在从高维度组学数据中识别生物标志物时使用。
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bio-single-cell-multimodal-integration
分析多模态单细胞数据（CITE-seq、Multiome、空间）。当处理每个细胞测量多个模态的数据时使用，例如RNA + 蛋白质或RNA + ATAC。在分析CITE-seq、Multiome或其他多模态单细胞数据时使用。
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bio-workflows-cytometry-pipeline
从FCS文件到差异分析的端到端流式细胞术工作流程。通过CATALYST/diffcyt协调补偿、转换、门控/聚类和统计测试。在端到端处理流式或质谱流式细胞数据时使用。
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run-research
当用户要求“研究一个主题”、“运行研究”、“最近30天”、“X发生了什么”、“人们在说X的什么”、“找到最好的X”、“X提示”、“关于X的最新消息”、“X新闻”、“人们推荐X的什么”、或想要知道近几周内任何主题的趋势、讨论或辩论时，应该使用此技能。
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sirv-ai-studio
使用Sirv AI Studio（www.sirv.studio）的指南，这是一个基于人工智能的图像和视频处理平台。当处理产品图片、去除背景、图像放大、AI生成、视频创建、批量处理或电子商务图像工作流程时，请使用此指南。在提到Sirv AI Studio、产品摄影、去除背景、图像放大、AI图像生成、批量图像处理或市场优化时触发。重要提示 - 如果有sirv-ai MCP工具可用（如sirv_rem…
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youtube-download
使用 yt-dlp 下载 YouTube 视频、音频或字幕。Use when user wants to 下载视频, 下载YouTube, youtube下载, 下载油管, download youtube, download video, 下载B站, bilibili下载.
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nlp-supply-chain
当用户希望将自然语言处理应用于供应链，从文档中提取信息，分析供应商通信，对物品进行分类，或处理非结构化文本时。也适用于用户提到“自然语言处理”、“NLP”、“文本挖掘”、“文档提取”、“供应商情绪分析”、“基于文本的产品分类”、“BERT”、“用于文本的转换器”或“用于供应链的聊天机器人”。对于一般的机器学习，请参阅ml-supply-chain。
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bio-genome-annotation-functional-annotation
使用eggNOG-mapper和InterProScan为预测的蛋白质分配GO术语、KEGG直系同源物、Pfam结构域和EC编号。生成用于下游通路分析和富集分析的功能摘要。在为预测基因添加功能注释或表征新基因组中的蛋白质功能时使用。
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bio-reporting-figure-export
导出适合出版的图形，支持多种格式，并具有适当的分辨率、尺寸和版式。在准备期刊提交的图表、为演示文稿创建矢量图形或确保分析中图表样式一致时使用。
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bio-temporal-genomics-circadian-rhythms
使用CosinorPy余弦模型、MetaCycle（JTK_CYCLE, ARSER）和RAIN非参数测试，在时间序列组学数据中检测昼夜节律和超日节律。拟合余弦模型以估计相位和振幅，并在预设周期上测试节律性显著性。适用于在昼夜、进食-禁食或光照-黑暗循环实验中测试24小时或其他已知周期的振荡情况。不适用于未知周期的发现（参见temporal-genomics/periodicity-detecti…
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grey-haven-llm-project-development
使用经过验证的方法构建基于大语言模型的应用程序和管道——任务-模型匹配分析、管道架构、结构化输出、基于文件的状态以及成本估算。在构建AI功能、数据处理管道、代理或任何集成大语言模型的系统时使用。受Karpathy的方法论和生产案例研究启发。
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cody-article-writer
文章写作和草稿管理工具。激活以下确切命令：“显示我的草稿”，“显示我的存档”，“显示我的文章”，“列出我的写作风格”，“创建新的文章风格”，“编辑风格”，“删除风格”，“继续我的文章”，“重新导出”。此外，每当有人想要撰写、计划、概述或研究博客文章、文章、论文或思想领导力作品——任何关于某个主题的长篇书面内容时也激活。这包括像“我想写关于X”或“帮我构建一篇关于Y的文章结构”这样的非正式请求。涵盖…
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imaging-data-commons
使用idc-index从NCI影像数据共享中查询和下载公共癌症影像数据。用于访问大规模放射学（CT、MR、PET）和病理数据集，适用于AI训练或研究。无需认证。按元数据查询，在浏览器中可视化，检查许可证。
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media-adaptation
系统地分析现有媒体，以提取可用于新场景的可转移元素。当将电视、电影或游戏改编为小说，跨类型转换套路，或为新背景转换类型元素时使用。
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openclaw-mem
本地优先的RAG记忆系统，适用于AI代理。渐进式披露搜索、会话自动捕获、每个项目的上下文大脑目录、注入防御。
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