Skill 资源库

AI Skill 资源库

把 Skill 的源码、资源快照、README、包体和安装信号放进一个可搜索、可筛选的公开目录。

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bio-pdb-structure-navigation

使用Biopython的Bio.PDB SMCRA模型浏览蛋白质结构层次。在访问模型、链、残基和原子,遍历结构层级或从PDB文件中提取序列时使用。

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bio-variant-calling-joint-calling

使用GATK CombineGVCFs和GenotypeGVCFs对多个样本进行联合基因型鉴定。对于队列研究、群体遗传学以及利用VQSR至关重要。在对多个样本执行联合基因分型时使用。

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bio-variant-calling

使用bcftools mpileup和call从比对的reads中调用SNPs和indels。在从BAM文件检测变异或从比对生成VCF时使用。

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bio-workflows-genome-assembly-pipeline

从读取到完成组装的端到端基因组组装工作流程,包括质量控制。支持短读(SPAdes)、长读(Flye)和混合方法。在从原始读取数据组装基因组时使用。

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bio-workflows-microbiome-pipeline

从FASTQ读取到差异丰度的端到端16S扩增子工作流程。协调DADA2 ASV推断、分类分配、多样性分析以及使用ALDEx2进行成分测试。在处理16S/ITS扩增子数据时使用。

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atlas-expert

专门从事Gravito的Atlas ORM和数据库设计。触发此功能进行模式设计、迁移或复杂查询构建。

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mcp-tool-discovery

当用户询问“可用工具”、“什么工具”、“如何查找工具”、“工具搜索”、“MCP服务器”、“列出工具”、“发现工具”、“哪些工具”,或者需要关于发现和使用Snow-Flow MCP工具的指导时,应使用此技能。

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bio-variant-calling-structural-variant-calling

使用Manta、Delly和LUMPY从短读长测序数据中调用结构变异(SVs)。检测标准SNV调用器无法识别的大片段缺失、插入、倒位、重复和易位。在从短读长数据中检测结构变异时使用。

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bio-vcf-manipulation

使用bcftools合并、连接、排序、取交集和子集VCF文件。在合并变异文件、比较调用集或重组VCF数据时使用。

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bio-workflows-genome-annotation-pipeline

从组装的重叠群到功能注释的端到端基因组注释流程,涵盖重复序列屏蔽、基因预测以及针对原核生物和真核生物基因组的功能分配。在从零开始注释新组装的基因组时使用。

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bio-workflows-tcr-pipeline

从FASTQ到克隆型多样性指标的端到端TCR/BCR谱系分析。用于分析来自批量或单细胞实验的免疫谱系测序数据。

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greptimedb-pipeline

创建GreptimeDB Pipeline的指南,通过该指南用户可以在数据摄入和存储之间为GreptimeDB添加一个处理层,以转换数据。

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grey-haven-suite-audit

元级插件套件审计员,使用子代理分析任何插件的可用性改进、缺失的代理、重复以及工作流优化。生成包含用户批准的任务转换的综合报告。触发词:'audit suite', 'analyze plugin usability', 'find duplicate agents', 'suggest new agents', 'optimize plugin workflow', 'plugin gap ana…

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request-management

当用户请求“服务请求”、“RITM”、“请求项”、“目录请求”、“履行”、“请求工作流”、“审批”,或任何ServiceNow请求管理开发时,应使用此技能。

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bio-temporal-genomics-temporal-grn

从批量时间序列表达数据中推断动态基因调控网络,使用的方法包括格兰杰因果关系(statsmodels)、dynGENIE3(基于ODE导出的表达衍生物的极端随机树)和动态贝叶斯网络(bnlearn)。识别时滞调控关系,并跟踪不同条件下的网络重连。当从批量时间表达数据中推断因果调控关系或检测转录因子随时间的影响传播时,请使用此方法。不适用于静态共表达网络(请参见gene-regulatory-netw…

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bio-variant-normalization

使用bcftools norm标准化indel表示并拆分多等位基因变异。在比较来自不同调用者的变异或准备用于下游分析的VCF文件时使用。

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bio-workflows-fastq-to-variants

从FASTQ文件到变异调用的端到端DNA测序工作流程。涵盖了质量控制、使用BWA进行比对、BAM文件处理以及使用bcftools或GATK HaplotypeCaller进行变异调用。在从原始测序读数调用变异时使用。

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bio-workflows-multiome-pipeline

端到端的多组学工作流程,用于联合scRNA-seq + scATAC-seq分析。涵盖了数据加载、单独模态处理以及使用Seurat/Signac进行WNN整合。在分析联合scRNA+scATAC数据时使用。

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"gitlab-webhook"

通过API进行GitLab webhook操作。当用户想要执行以下操作时,始终使用此技能:(1) 列出/查看webhooks,(2) 创建/更新/删除webhooks,(3) 配置webhook事件,(4) 测试webhook发送。

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grey-haven-onboarding-coordination

通过个性化计划、Linear集成、知识库设置和里程碑跟踪来自动化开发人员入职流程。在新开发人员入职、团队扩张规划或管理角色转换时使用。

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auto-todo

调用“autotodo”、“auto-todo”、“生成任务清单”、“转成todolist”,或任何将需求文档转换/分解为todolist.md的请求。这是需求与编码之间的桥梁:它读取一个需求规范(markdown文件)并输出一个分阶段、按依赖顺序排列的todolist.md,准备用于自动开发。当用户拥有需求文档并希望从中提取任务时触发,或者在自动需求后询问“下一步”,提到将功能分解为任务列表,或…

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scheduled-jobs

当用户要求“创建计划任务”、“计划脚本”、“定时任务”、“自动化计划”、“重复性任务”、“批处理”、“夜间任务”,或任何ServiceNow计划任务开发时,应使用此技能。

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