此技能从BAM文件生成标准化的BigWig（.bw）轨迹（和/或倍数变化轨迹），用于ATAC-seq和ChIP-seq可视化。它自动处理归一化（RPM或倍数变化）以及Tn5偏移校正。此外，该技能可以帮助用户可视化TSS或目标区域周围的信号轮廓。当您已经过滤并生成了干净的BAM文件（例如`*.filtered.bam`）时，请使用此技能。

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brand-guidelines

将Anthropic的官方品牌颜色和字体应用于任何可能受益于Anthropic外观和感觉的物品。在需要应用品牌颜色或样式指南、视觉格式或公司设计标准时使用。

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hic-matrix-qc

此技能对存储在.mcool或.cool格式中的Hi-C接触矩阵执行标准化的质量控制（QC）。它使用cooler和cooltools计算覆盖率和cis/trans比率、距离依赖的接触衰减（P(s)曲线）、覆盖率均匀性以及在选定分辨率下的重复相关性。使用它来评估Hi-C数据是否具有足够的质量以进行下游分析，如拓扑关联域（TAD）识别、环检测和区室分析。

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loop-annotation

该技能注释染色质环，包括增强子/启动子分配、CTCF峰值重叠。当缺少时，它会自动构建增强子和启动子集合，并输出标准化的环类别。

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execute

以速度和质量执行任务。在明确性和优先级确定完成后准备实施时使用。这是5系统框架中的第四个系统。

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webapp-testing

使用Playwright与本地Web应用程序交互和测试的工具包。支持验证前端功能、调试UI行为、捕获浏览器截图以及查看浏览器日志。

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reset

在失败、遇到障碍或卡住时重置。当执行遇到困难、出现问题，或者我们需要退一步重新评估时使用。这是5系统框架中的第五个系统。

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obsidian-bases

创建和编辑Obsidian Bases（.base文件），包括视图、过滤器、公式和摘要。在处理.base文件、创建类似数据库的笔记视图，或当用户提到Bases、表格视图、卡片视图、过滤器或公式时使用。

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file-organizer

通过理解上下文、查找重复项、建议更好的结构以及自动化清理任务，智能地组织您计算机上的文件和文件夹。减少认知负担，无需手动操作即可保持您的数字工作空间整洁。

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差异区域分析流程使用基于计数的框架和DESeq2来识别实验条件下信号强度存在显著差异的基因组区域。它支持从开放染色质测定（例如，ATAC-seq、DNase-seq）检测差异可访问区域(DARs)，以及从以转录因子为中心的测定（例如，ChIP-seq、CUT&RUN、CUT&Tag）中检测差异转录因子(TF)结合区域。该流程可以从对齐的BAM文件或预计算的计数矩阵开始，并适用于任何可以将基因组信号…

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