schema-e2e-validation
运行Earthly E2E验证以检验YAML模式合约。在验证YAML模式变更、针对实时ClickHouse测试模式合约或从YAML重新生成Python类型、DDL和文档时使用。对于SQL模式设计和优化,请改用clickhouse-architect技能。
把 Skill 的源码、资源快照、README、包体和安装信号放进一个可搜索、可筛选的公开目录。
运行Earthly E2E验证以检验YAML模式合约。在验证YAML模式变更、针对实时ClickHouse测试模式合约或从YAML重新生成Python类型、DDL和文档时使用。对于SQL模式设计和优化,请改用clickhouse-architect技能。
验证并检查结构化数据文件(YAML、JSON、TOML)的一致性、必填字段、语法错误和模式合规性。
创建一个适合DOI的学术版本的翻译书籍。当被要求出版、创建版本、生成DOI或为学术出版准备书籍时使用。生成前言,创建版本化版本,构建EPUB,并通过Zenodo生成DOI。
将Synnovator数据模式转换为OpenAPI 3.0规范。使用场景:(1)需要根据Synnovator的内容类型和关系生成REST API规格书;(2)为api-builder技能准备输入以构建后端代码;(3)希望从Synnovator数据模型中获得标准化、符合REST风格的API设计。触发词:"generate openapi", "create api spec", "convert s…
通过将物体接入电路并观察灯泡来判断该物体是否导电。在基于导电性对物体进行分类时触发。
从基因表达数据中使用可扩展算法(如GRNBoost2、GENIE3)推断基因调控网络(GRNs)。在分析转录组学数据(批量RNA-seq,单细胞RNA-seq)时使用,以识别转录因子-靶基因关系和调控相互作用。支持大规模数据集的分布式计算。
统一的Python接口,可访问40多种生物信息学服务。当在一个工作流中使用一致的API查询多个数据库(如UniProt、KEGG、ChEMBL、Reactome)时,请使用此接口。最适合跨数据库分析和服务之间的ID映射。对于快速单个数据库查找,请使用gget;对于序列/文件操作,请使用biopython。
用于处理超过RAM大小的pandas/NumPy工作流的分布式计算。当需要将现有的pandas/NumPy代码扩展到内存之外或跨集群时使用。最适合并行文件处理、分布式机器学习、与现有pandas代码集成。对于单机上的外部核心分析,请使用vaex;对于内存速度,请使用polars。
跨环境的数据库模式验证和漂移检测
使用schemachange进行版本控制,部署和管理Snowflake数据库对象。当您需要为dbt未处理的对象管理数据库迁移、为模式更改实现CI/CD管道,或在多个环境间协调部署时,请使用此技能。
GNU Scheme生态系统 = guile + goblins + hoot + fibers
构建符合PRISMA 2020标准的系统文献回顾系统,使用RAG支持的分析在VS Code中进行。当研究人员需要自动检索论文(如Semantic Scholar, OpenAlex, arXiv)、AI辅助的PRISMA筛选(50%或90%阈值)、向量数据库创建(ChromaDB)或者研究对话界面时,请使用此系统。支持知识库模式(全面覆盖,包含15,000+篇论文,适用于教学/探索)和系统性回顾模…
用于自动化蛋白质测试和验证的云实验室平台。在设计蛋白质并需要实验验证时使用,包括结合测定、表达测试、热稳定性测量、酶活性测定或蛋白质序列优化等。也可用于通过API提交实验、跟踪实验状态、下载结果、使用计算工具(如NetSolP、SoluProt、SolubleMPNN、ESM)优化蛋白质序列以获得更好的表达,或管理包含湿实验验证的蛋白质设计工作流程。
Google量子计算框架。当目标为Google Quantum AI硬件、设计考虑噪声的电路或运行量子特性实验时使用。最适合Google硬件、噪声建模和低级电路设计。对于IBM硬件,请使用qiskit;对于带有自动微分的量子机器学习,请使用pennylane;对于物理模拟,请使用qutip。
通过API v2查询ClinicalTrials.gov。根据病情、药物、地点、状态或阶段搜索试验。通过NCT ID检索试验详情,导出数据,用于临床研究和患者匹配。
与Data Commons合作,这是一个提供程序化访问来自全球来源的公共统计数据的平台。在处理人口数据、经济指标、健康统计、环境数据或通过Data Commons可获得的任何公共数据集时使用此技能。适用于查询人口统计数据、GDP数字、失业率、疾病流行情况、地理实体解析以及探索统计实体之间的关系。
使用严格的Pydantic模型验证简历负载。确保在处理前简历JSON符合所需的结构。
使用ScholarEval框架系统地评估学术工作,从问题构建、方法论、分析和写作等研究质量维度提供结构化的评估,并给出量化评分和可操作的反馈。
收集单一的Schwab MCP数据快照(账户、报价、指标、期权链),并设置五分钟缓存,以便交易代理可以重用一致的输入。每当期权角色需要在推荐交易前获取最新的风险、市场或链数据时,请使用此方法。
此技能对代理库存中的工具执行基本功能检查。应在获取工具后但在首次用于关键任务步骤之前触发,以确保其可操作性。该技能通常会对工具使用'focus'或'examine'动作,并确认其就绪状态。
单细胞分析中标注矩阵的数据结构。在处理.h5ad文件或与scverse生态系统集成时使用。这是数据格式技能——对于分析工作流,请使用scanpy;对于概率模型,请使用scvi-tools;对于群体规模查询,请使用cellxgene-census。
Google量子计算框架。当针对Google Quantum AI硬件、设计抗噪电路或运行量子特性实验时使用。最适合Google硬件、噪声建模和低级电路设计。对于IBM硬件,请使用qiskit;对于具有自动微分的量子机器学习,请使用pennylane;对于物理模拟,请使用qutip。
基于约束的代谢建模(COBRA)。包括FBA、FVA、基因敲除、通量采样、SBML模型,用于系统生物学和代谢工程分析。
通过API/FTP访问欧洲核酸档案库。检索DNA/RNA序列、原始读取(FASTQ)、基因组组装等,支持通过访问号获取数据,适用于基因组学和生物信息学流程。支持多种格式。