bio-workflows-metabolomics-pipeline
从原始质谱数据到通路分析的端到端代谢组学工作流程。协调XCMS预处理、注释、归一化、统计分析和通路映射。在处理LC-MS代谢组学数据时使用。
把 Skill 的源码、资源快照、README、包体和安装信号放进一个可搜索、可筛选的公开目录。
从原始质谱数据到通路分析的端到端代谢组学工作流程。协调XCMS预处理、注释、归一化、统计分析和通路映射。在处理LC-MS代谢组学数据时使用。
从FASTQ到翻译效率和ORF检测的端到端Ribo-seq分析。在分析核糖体图谱数据以研究翻译时使用。
使用Mutect2或Strelka2从肿瘤-正常配对样本中进行端到端的体细胞变异检测。涵盖癌症基因组学中的预处理、变异检测、过滤和注释。在从肿瘤-正常配对样本中检测体细胞突变时使用。
在Gravito DDD中具有战略和战术专长。当需要有界上下文、聚合体和事件驱动架构的复杂领域时触发此功能。
应用Grey Haven数据库规范 - 使用snake_case字段,多租户支持tenant_id和RLS(行级安全),适当的索引,为Drizzle(TypeScript)和SQLModel(Python)创建迁移。在设计模式、编写数据库代码、创建迁移、设置RLS策略时使用,或者当用户提到'database'、'schema'、'Drizzle'、'SQLModel'、'migration'、'R…
在标记完成之前,通过视觉检查确认已实现的功能正确无误。适用于测试用户界面更改、验证网页功能或检查用户流程是否在浏览器中正常工作。
PostgreSQL优化,包括索引、查询计划、分区、JSONB操作和连接池
Terraform提供者验收测试运行指南。当被要求运行验收测试或运行带有`TestAcc`前缀的测试时,请使用此指南。
从FASTQ到差异甲基化区域的端到端亚硫酸氢盐测序工作流程。涵盖Bismark比对、甲基化位点鉴定以及使用methylKit进行DMR检测。在分析亚硫酸氢盐测序数据时使用。
从FASTQ到差异miRNA表达的端到端小RNA-seq分析。适用于分析miRNA、piRNA或其他小RNA测序数据。
从FASTQ到差异剪接结果的端到端替代剪接分析。使用STAR双遍模式进行比对,执行接合质量控制,运行rMATS-turbo进行差异分析,并生成sashimi可视化。当从原始RNA-seq数据进行全面剪接分析时使用。
6阶段验证系统,确保代码与文档匹配,并通过自动化对齐评分(签名、类型、行为、错误、示例检查)。减少40%的入职摩擦。在验证代码-文档对齐、开发人员入职、代码更改后、发布前文档检查时使用,或者当用户提到'文档不同步'、'文档验证'、'代码-文档对齐'、'文档准确性'、'文档漂移'或'验证文档'时使用。
全面的Claude Code插件审计技能,用于验证结构、检测已弃用模式,并基于最新变更日志推荐最佳实践。在审计插件、检查是否过时、验证插件结构、准备发布插件或确保与最近的Claude Code版本兼容时使用。触发词:'audit plugin', 'check plugin health', 'validate skill', 'plugin deprecation', 'changelog co…
当用户要求“修复技能”、“审核技能”、“修正我的技能”、“改进现有技能”、“审查技能质量”、“检查我的技能是否编写良好”、“诊断技能问题”、“这个技能有什么问题”、“改进这个技能”、“这个SKILL.md有什么问题”,或者询问关于现有技能可以改进的地方时,应该使用此技能。
完整的访问控制列表管理 - 了解ACL结构、创建/修改ACL、解决权限问题及调试技巧
在Go Gin API中实现身份验证和授权。涵盖JWT中间件(jti黑名单、刷新轮换)、登录/注册处理器、bcrypt密码哈希、基于角色的访问控制(RBAC)、CSRF保护、对认证端点的速率限制、安全cookie以及管理员模拟防护。当向Gin应用程序添加身份验证、登录、注册、JWT令牌、用户会话、权限或角色检查时使用。
从MaxQuant输出到差异蛋白质丰度的端到端蛋白质组学工作流程。协调数据导入、归一化、插补以及使用MSstats或limma进行统计测试。在处理质谱蛋白质组学时使用。
从FASTQ文件到差异表达结果的端到端RNA-seq工作流程。涵盖质量控制、定量(Salmon或STAR+featureCounts)以及使用可视化进行DESeq2分析。当从FASTQ运行至差异表达结果时使用。
从表达矩阵到时间模式和富集的端到端时间进程分析。涵盖时间差异表达、Mfuzz软聚类、可选的节奏检测、GAM轨迹拟合以及每簇通路富集。适用于任何组学平台的大规模时间序列表达实验分析。
掌握TDD编排,包括多代理协调、严格的红绿重构执行、自动化测试生成、覆盖率跟踪以及超过90%的覆盖率质量门。支持Claude Teams进行并行TDD工作流程,并设有计划审批门,或者回退到顺序子代理协调。协调tdd-python、tdd-typescript和test-generator代理。在使用TDD工作流程实现功能、协调多个TDD代理、强制执行测试优先开发、编排TDD团队时使用,或当用户提到…
当用户要求“创建测试”、“ATF”、“自动化测试”、“测试套件”、“测试步骤”、“回归测试”、“单元测试”,或任何ServiceNow自动化测试框架开发时,应使用此技能。
实时串行日志监控,适用于ESP32和微控制器。捕获设备输出到文件并实时监控日志。在调试嵌入式设备、调查崩溃或监控设备行为时使用。
在编写导入"@vue/test-utils"的代码时始终使用。咨询有关调试、最佳实践或修改@vue/test-utils, vue/test-utils, vue test-utils, vue test utils, test-utils, test utils的信息。
根据审阅反馈和CI失败修复拉取请求,然后发布审阅回复。