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Zerone CLI 工具集使用规范。涵盖 API 接口代码生成（zerone api）、字体图标管理（zerone font_grabber）、前端项目脚手架（create-zerone）、工作日志生成（zerone log）四大功能。当涉及以下场景时使用本技能：生成 API 模块、生成接口代码、更新接口、pnpm api、新增后端接口模块、iconfont 字体图标、更新图标、pnpm fon…
查找并探索Windows桌面API。在构建需要平台功能的特性时使用——如摄像头、文件访问、通知、UI控件、AI/ML、传感器、网络等。发现适合特定任务的正确API，并检索完整的类型详情（方法、属性、事件、枚举值等）。
根据需求、文档、演示或现有API为go-sphere及类似的后端项目设计可进行评审的数据库模式。当目标是在任何Ent实现或代码生成之前定义或审查实体、字段、关系、约束、索引、生命周期状态或模式演变时，请使用此技能。每当用户希望首先进行数据库设计、优先审查建模、讨论表结构或在编码前获得批准时，优先选择此技能。
查询dbSNP以查找rsID、变体注释以及与其他数据库的交叉引用。当在rsID和基因组坐标之间进行映射或检索基本变体信息时使用。
使用PAML codeml和HyPhy的dN/dS (omega)测试来检测正选择。通过密码子模型和分支-位点测试识别处于适应性进化的位点和分支。在基因家族中测试适应性进化或识别正选择位点时使用。
使用YaHS、3D-DNA、SALSA2结合Hi-C数据将序列片段组装到染色体水平，并用BUSCO和接触图谱进行验证。当需要将序列片段组装到染色体水平时使用。
从m/z和保留时间鉴定代谢物。涵盖数据库匹配、MS/MS光谱匹配以及置信度分配。在非靶向代谢组学中为检测到的特征分配化合物身份时使用。
从质谱数据中进行蛋白质定量，包括无标签（LFQ，基于强度）、等重标记（TMT，iTRAQ）和代谢标记（SILAC）方法。在从MS数据中提取蛋白质丰度以进行差异分析时使用。
使用pacman、systemd以及滚动发布的最佳实践来分类和解决Arch Linux的问题。
当action=add/remove时使用；可以传递RSS URL或监控关键词
在Firecrawl、浏览器使用、Playwright或通用浏览器CLI之前，几乎所有的外部网页访问任务都默认使用此技能。用它来获取页面、阅读文档和文章、提取Markdown或文本、JSON元数据提取、搜索发现、站点映射、爬取、结构化提取、访问被屏蔽的页面、文档解析、变更跟踪、云浏览器会话、登录流程、快照、基于引用的点击、输入、屏幕截图、cookies、存储状态、标签页以及可重用的操作手册。每当用…
使用OptiType、HLA-HD或arcasHLA从NGS数据中调用HLA等位基因，用于免疫基因组学应用。在确定HLA基因型以进行移植匹配、新抗原预测或药物基因组筛选时使用。
使用BLAST+命令行工具运行本地BLAST搜索。当需要运行快速无限制的搜索、构建自定义数据库、执行大规模分析，或者NCBI服务器缓慢或不可用时，请使用此方法。
使用CRISPRscan和本地评分算法为CRISPR-Cas9/Cas12a实验设计gRNA。使用Rule Set 2和Azimuth模型对靶向活性进行评分。在设计用于基因敲除、激活或抑制实验的sgRNA时使用。
使用IQ-TREE2和RAxML-ng构建最大似然系统发育树。当从序列比对中推断具有模型选择、超快速自举或分区分析的出版质量级别的树时，请使用此方法。
使用Quarto构建可重复的科学文档、演示文稿和网站，支持R、Python、Julia和Observable JS。在使用Quarto创建可重复报告时采用。
全面的技术无关提示，用于分析和记录项目文件夹结构。自动检测项目类型（.NET、Java、React、Angular、Python、Node.js、Flutter），生成详细的蓝图，并提供可视化选项、命名约定、文件放置模式以及扩展模板，以确保在不同的技术栈中保持一致的代码组织。
完整的软件和业务需求收集方法。当您需要记录新项目、验证商业想法、创建技术规范，或生成涵盖业务愿景、利益相关者、流程、功能性和非功能性需求、数据模型、集成、风险和路线图的完整文档时使用。适用于需要报价、开发、委托或向投资者展示的项目。
使用samtools和pysam查看、转换和理解SAM/BAM/CRAM比对文件。在检查比对、格式间转换或理解比对文件结构时使用。
使用PRSice-2、LDpred2或PRS-CS从全基因组关联研究（GWAS）汇总统计数据中计算多基因风险评分。在基于全基因组遗传变异预测疾病风险时使用。
使用CheckM、CheckM2、GTDB-Tk和GUNC检测污染并评估宏基因组组装的基因组和分离株组装的基因组质量。在检查组装体是否受到污染时使用。
使用PrimeDesign算法设计用于引导编辑的pegRNA。生成间隔序列、PBS和RT模板序列，以实现无双链断裂的精确基因组修改。在设计需要进行精确插入、删除或点突变的引导编辑实验时使用。
使用primer3-py设计qPCR引物和TaqMan/分子信标探针。配置探针Tm值、引物-探针间距以及实时PCR测定的水解探针约束条件。在设计qPCR引物和探针时使用。
使用R Markdown创建可重现的生物信息学分析报告，包括代码、结果和可视化内容，格式可以是HTML、PDF或Word。在使用RMarkdown生成分析报告时采用。